Η απόσβεση ενός αυτόνομου συστήματος εξαρτάται απο το κόστος εγκατάστασης του συστήματος καθώς και απο τα οφέλη που θα έχει εφόσον δεν θα υπάρχουν λογαριασμοί ρεύματος.
Για παράδειγμα, εάν ένα εξοχικό σπίτι πληρώνει 500 – 600 ευρώ το χρόνο σε ρεύμα, ένα αυτόνομο σύστημα θα κοστίσει απο 1200 εως 2000 ευρώ. Έτσι, εάν κάθε χρόνο αυτά τα 500 – 600 ευρώ εξοικονομούνται, η απόσβεση γίνεται σε 2 με 2.5 χρόνια.
Ωστόσο, σε μια μεγαλύτερη και μόνιμη κατοικία, οι καταναλώσεις, και εν συνέπεια οι λογαριασμοί ρεύματος, είναι πολλές φορές μεγαλύτεροι, γεγονός που αυξάνει και το κόστος του συστήματος επίσης. Σε μια τέτοια περίπτωση, με πρόχειρους υπολογισμούς, η απόσβεση γίνεται σε 8 με 12 χρόνια. Σαφώς, με σταδιακή αύξηση των τιμών ρεύματος, το διάστημα απόσβεσης γίνεται ακόμα μικρότερο. Έτσι, η εγκατάσταση ενός αυτόνομου φωτοβολταϊκού συστήματος, απαλάσσει τον ιδιοκτήτη απο τις μελλοντικές αυξήσεις των τιμών ρεύματος.